Родился в Москве. Отец Ковтюх Е.И. - легендарный герой Гражданской войны, комкор, армейский инспектр, зам. ком. Белорусским военным округом, трижды орденосец Боевого Ордена "Красного Знамени". О его подвигах написаны книги (А. Серафимович "Железный поток"; Д. Фурманов "Красный десант") и снят фильм (Е. Дзиган "Железный поток").

Мать тоже участница гражданской войны. До 17 лет воспитывался и жил в семье отца, учился в средней школе. В 1936 был принят в комсомол. 

10 августа 1937 года отца, Епифана Иовича арестовали и, по обвинению в участии в военном заговоре, 29 июля 1938 года приговорили к расстрелу. Приговор приведён в исполнение в тот же день. 17-летнего Валентина Епифановича и его мать арестовали вскоре после ареста отца, 14 ноября 1937 г. Мать была приговорена к 8 годам ИТЛ, Валентин к 5 годам ИТЛ. Младшего брата Бориса (12 лет) поместили в детдом (позже: инвалид ВОВ; впоследствии семья воссоединится). Валентин Епифанович был направлен в Карлаг (Каз. ССР). Работал в угольных шахтах навалоотбойщиком, землекопом на строительстве Джартасской плотины и др.

В ноябре 1942 закончился назначенный срок, но Ковтюх не был освобожден из-за военного положения. Только 2 мая 1946 года Ковтюх Валентин был освобожден. Ему было дано разрешение выехать из Казахстана и Ковтюх приехал в Москву. По пути навестив мать, которая еще в то время находилась в темниковском лагере около пос. Явас. Не имея возможности устроиться на работу в Москве, Ковтюх решил уехать на родину предков - Кубань. Там тоже долго были проблемы с устройством, но Валентину Епифановичу повезло и он устроился тестомесом хлебопекарни Пашковского района.

В 1946 году, проездом в Москве, Валентин Епифанович встретил школьную подругу. Вскоре они поженились и родилась дочь Людмила. В 1948 всей семьей переехали в Смоленск. Работает помощником тестомеса на Смоленской хлебопекарне №2, а осенью поступает в Московскую 3-годичную школу машинистов локомотивов. Но 29 октября 1949 Ковтюха арестовывают вторично. Сослан в Казахстан сроком на 10 лет.

В 1950 переводят в поселок Актау на вольфрамо-молибденовый рудник инструктором физкультуры профсоюза рудкома. После амнистии в 1953, Валентину Епифановичу в 1955 разрешено было продолжать обучение в 3-годичной школе машинистов локомотивов в Алма-Ате (окончил в 1956).

После посмертной реабилитации отца на ХХ съезде партии, были реабилитированы Валентин Епифанович и мать. Их пригласили в Москву, где были приняты Правительством, Секретарем ЦККПСС, Министром обороны СССР. Валентину с матерью выделили комнату, матери установили пенсию, а Валентина трудоустроили в локомотивное депо Москва-Сортировочная. В 1966 г. был переведен на Московский локомотиворемонтный завод машинистом-испытателем электровозов.

Источники: архив Мемориала; автобиогрфия В.Е. Ковтюха